新研究发现：SOX1基因高甲基化与肺癌患者预后相关

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关键词：基因患者研究发现新研究癌

资讯来源：基因谷

发布时间： 2023-03-20

肺癌是中国当前新发病例和死亡病例排名第一的肿瘤。其中，非小细胞肺癌（NSCLC）是肺癌的主要类型，约占所有肺癌患者的80%-85%。

目前手术仍是NSCLC患者首选的治疗方法，只有接受了根治性手术才有彻底治愈的可能。然而NSCLC患者术后复发转移是影响患者预后的关键因素，如何防止术后复发是医生和患者都非常关注的问题。

由于NSCLC存在异质性，包括组织学类型、分子特征和驱动基因等，使得患者复发存在较大差异。

甲基化变化在肺癌中已被广泛研究，其中一些已被指出作为潜在的生物标志物，与临床诊断、预后和治疗反应相关。

近日，标题为“Is hypermethylation of SOX1 gene an independent prognostic marker in surgically resected non-small cell lung cancer”的文章结果显示：SOX1启动子高甲基化在非小细胞肺癌(NSCLC)肿瘤中与较低的生存率显著相关，有望成为NSCLC患者有用的预后生物标志物。

研究共纳入65例接受非小细胞肺癌手术切除的患者，在手术过程中收集到了少量肿瘤标本、离肿瘤较远的正常肺组织和血液样本。这些患者均未接受新辅助化疗或放疗。

在接受手术时，有81.3%的患者吸烟，而其余的患者此前吸烟。所有患者年龄均在55岁以上，其中近一半患者在手术时年龄超过65岁。主要组织学类型为鳞状细胞癌(56%)，其次为腺癌。

表1.纳入患者信息

在本研究评估的所有基因中，肿瘤组织中内除了ESR1基因，其他基因所有CpG位点的平均甲基化显著高于正常相邻组织（表2）。

当将肿瘤某一特定基因高甲基化的患者和未高甲基化的患者的血液样本进行比较时，没有观察到统计学上的显著差异。

因此，这些结果表明在NSCLC中SOX1、RASSF1A、HOXA9、CDH13和DAPK基因中观察到的甲基化水平升高是癌症特异性的，而血液不适合进行筛查。

表2.CpG甲基化平均值和所有分析基因的标准差

5年生存率与年龄、性别、吸烟史、肿瘤组织学或分级无显著相关性。唯一具有统计学意义的生存预测因子是TNM分期(P=0.011，表3）。

因此，TNM分期是唯一用于调整Cox比例风险模型的协变量，该模型评估特定基因的肿瘤甲基化水平对5年生存率的影响。

表3.5年生存率与患者临床病理特征之间的关系

对于SOX1基因，模型确定肿瘤甲基化的临界值为29.11，高于肿瘤甲基化的平均值26.44（表2）。这个临界值清楚地区分了两组患者的5年生存率：高肿瘤甲基化的患者(虚线，图1a)的生存率低于低肿瘤甲基化患者。

相比之下，RASSF1A基因(第二引物)的截断值为9.01，低于肿瘤平均水平甲基化观察到该基因（10.44，见表2）。Kaplan-Meier生存曲线（图1b）没有显示甲基化肿瘤较少的组(低于9.01的肿瘤)有任何有利的生存。

图1.Kaplan-Meier生存曲线，根据SOX1 (a)和RASSF1A (b)基因的肿瘤甲基化状态

研究者在肿瘤组织中观察到所有被检测基因的高甲基化，而在正常组织(癌旁)中的甲基化与在匹配患者血液中观察到的甲基化相似，显示血液并不是肿瘤组织甲基化的合适指标。研究者还评估了肿瘤高甲基化是否与NSCLC的5年生存率相关。结果显示：肿瘤组织中SOX1基因高甲基化，高于所有肿瘤中甲基化平均值的患者生存期明显较差。

SOX1高甲基化在非小细胞肺癌中已有报道，SOX1是高甲基化程度最高的5个基因，与正常组织相比，肿瘤中的甲基化程度超过5倍。据报道，SOX1抗体是一种特定小细胞癌类型的血清学标记物，但未观察到该标记物与生存率之间的关系除了肺癌外，SOX1高甲基化也被报道在几种不同的恶性肿瘤中，包括卵巢癌、食管癌、前列腺癌和膀胱癌。

这是第一篇关于SOX1甲基化与NSCLC生存率之间关系的报道。综上所述，非小细胞肺癌SOX1基因高甲基化与患者预后不良相关。它可能作为一种新的基于表观遗传的诊断生物标志物，对NSCLC患者的风险分层有进一步的临床影响。但是由于样本量小，需要谨慎，需要进一步的研究来确认该标记对NSCLC的特异性。

参考资料：

1.DOI: 10.4103/jcrt.JCRT_125_20

2.基于分子标志的非小细胞肺癌术后复发预测专家共识

作者：甲基化叶子，转载请联系授权。