盘点 | 截止2021年3月,FDA获批伴随诊断产品

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关键词: 诊断获批FDA伴随诊断
资讯来源:基因谷
发布时间: 2021-03-12

肿瘤的精准治疗大致两种:一是通过靶向治疗药物,通过靶向结合肿瘤细胞中特定的基因突变位点,使肿瘤细胞特异性死亡,达到治愈癌症的效果;二是通过激活人体自身免疫系统,让免疫系统重新识别出逃逸的肿瘤细胞,从而抵抗并治愈癌症。由于个体差异,癌症患者要找到适用的药物,就必须得到自己独特的基因或表达,这种检测常常与精准治疗药物绑定使用,称为伴随诊断(CDx,companion diagnosis),属于体外诊断的细分领域。





正文目录

1. 前言

2. 靶向治疗药物与CDx

2.1 FDA批准的靶向药物
2.2 靶向药物CDx与生物标记物
3. 免疫治疗药物与CDx

3.1 细胞程序性死亡配体(PD-L1)

3.2 肿瘤突变负荷(TMB)

3.3 微卫星不稳定(MSI)/ 基因错配修复功能(MMR)

4. 其他及总结



01

前言


从法规角度来看,欧美国家在体外诊断试剂下已明确伴随诊断试剂这一子分类,美国市场,获得FDA批准的伴随诊断试剂共计44个。国内截止目前尚未有针对伴随诊断审批的相关法规,在体外诊断目录下也没有专门的伴随诊断分类,现阶段对伴随诊断试剂按照Ⅲ类IVD试剂审批与监管(III-3与人类基因检测相关的试剂,或III-6 与治疗药物靶点检测相关的试剂)。其中,与药物进行了联合临床试验的伴随诊断试剂,审批时会在适应症一栏标注“伴随诊断”或“辅助诊断”。因此,考虑到伴随诊断产品在FDA框架下较为明确,先行梳理,再根据FDA所批准生物标记物的特性对NMPA框架下的国内伴随诊断市场进行整理。





FDA批准的伴随诊断试剂(CDx) 在fda.gov上列举的非常详细,但放眼望去,光生物标记物就让人眼花缭乱,但实际上无非开头提到的:靶向药物的伴随诊断、免疫治疗的伴随诊断。



02

靶向治疗药物与CDx


肿瘤往往伴随着基因突变:人体内的细胞各司其职,一旦细胞中发生基因突变,则可能导致特定蛋白质/酶的产生,随之可能导致细胞过度分裂和生长,或使细胞的生命周期长于正常细胞,细胞不受控制并最终发展成肿瘤。在一些癌症中,研究者们通过发现上述基因突变序列或特异性的蛋白产物,找到相应的靶向药物精准作用于肿瘤细胞,阻断调控肿瘤细胞生长的信号,或干预肿瘤细胞的存活周期,抑或直接消灭肿瘤细胞。癌症患者的基因突变则决定了哪些靶向药物是有效的。


2.1

FDA批准的靶向药物

FDA Approved Targeted Therapies

FDA批准的靶向药物主要有两类:小分子药物和单克隆抗体(单抗)。小分子药物阻止肿瘤细胞繁殖的要素或过程,比如血管生成抑制剂,肿瘤细胞需要生成新的血管以传输营养物质供其生长,而血管生成抑制剂则通过阻止肿瘤附近组织生成血管,使肿瘤无法生长。单抗药物与肿瘤细胞表面/肿瘤周围环境的靶点相结合,阻止肿瘤生长,或定向传递毒性物质消灭肿瘤。单抗药物需要使用伴随诊断对基因突变或其蛋白质产物进行筛查。


2.2

靶向药物CDx与生物标记物

CDx and Corresponding Biomarkers


FDA批准的靶向药物伴随诊断试剂以HER2, EGFR, BRAF, FGFR等为主,FDA批准的44个CDx产品中,39个是此类试剂,除去FoundationOne CDx等包含多达324个基因靶点的panel类伴随诊断产品,其余产品统计如下,HER2为最常获批的靶点:


 

同时,按照癌种,针对乳腺癌、非小细胞肺癌及结直肠癌的获批伴随诊断产品最多,以下列举部分热门检测靶点及相应产品。



乳腺癌(Breast Cancer)

20-25%的乳腺癌患者都过量表达人表皮生长因子受体2(HER2),它能使肿瘤细胞增长。目前已有很多针对HER2阳性的肿瘤靶向药物和CDx试剂。



Note: *标记为Panel类产品

非小细胞肺癌(NSCLC)

靶向抑制EGFR的药物也可以减缓肺癌的发展,尤其在EGFR有某些基因突变的情况下。同时,具有ALK和ROS基因突变的肺癌也有相应靶向药物,也有一些场合医生会使用血管生成抑制剂。


Note: *标记为Panel类产品



结直肠癌(Colorectal Cancer)

结直肠癌患者通常过量表达表皮生长因子受体(EGFR),同时EGFR不具有KRAS突变,靶向抑制EGFR的药物可以减缓肿瘤发展。另外,抑制血管生长因子(VEGF)的药物也可以通过阻断新血管生成,减缓肿瘤的发展。


Note: *标记为Panel类产品



慢性粒细胞白血病(CML)

几乎所有的慢性粒细胞白血病都是由BCR-ABL基因的形成驱动。这种基因导致BCR-ABL蛋白酶的形成,使正常骨髓粒细胞像癌细胞一样不受控制地增生。



黑色素瘤(Melanoma)

几乎一半的黑色素瘤在BRAF基因中有突变。BRAF是一种非常有效的药物靶点,因此FDA批准了不少BRAF抑制类的靶向药。同时,BRAF靶向药对没有BRAF突变的肿瘤也有明显的副作用。



Note: *标记为Panel类产品


此外,还有很多FDA批准的伴随诊断靶点,感兴趣更多基因靶点的解释说明可以浏览这里:https://circulogene.com/clinicians-and-researchers/gene-descriptions/


03

免疫治疗药物与CDx


肿瘤免疫治疗是继手术、放疗、化疗、靶向治疗之后的第五大疗法。 常见的生物标记物包括PD-L1,TMB, MSI和MMR。


3.1

细胞程序性死亡配体(PD-L1)

Programmed Death-ligand 1

PD-L1是一种普遍表达于人体各类细胞表面的蛋白,传导免疫抑制信号,与T细胞表面PD-1受体结合可抑制免疫效应T细胞的活性,防止激活型T细胞过度反应。当PD-L1表达与肿瘤细胞表面,这一免疫系统“刹车”功能则被肿瘤细胞所利用,造成肿瘤细胞的免疫逃逸。免疫检查点抑制剂正是阻断PD-1/PD-L1这一信号通路,使免疫系统不被“刹车”,进而行使正常的杀伤肿瘤细胞的功能,从而治疗肿瘤、患者获益。


免疫组化检测(IHC

免疫组织化学检测(IHC)是病理诊断中常用的一种检测手段,它是利用带标记的特异性抗体(或抗原)与组织内抗原(或抗体)进行特异性结合并通过化学反应使标记抗体显色,以此来对组织细胞内抗原进行定位、定性及定量的研究。



PD-L1的检测

PD-L1检测的CDx产品均为免疫组化平台的检测。免疫组化(IHC)基于细胞蛋白水平的检测,其染色的判读方法和结果的判读标准差异较大:判读方法主要依据PD-L1表达于肿瘤细胞(TC)还是肿瘤浸润免疫细胞(IC);判读标准也有两种,其一,肿瘤比例评分(Tumor  Proportion Score–TPS),即着色阳性的肿瘤细胞数占所有肿瘤细胞数的百分比;其二,联合阳性评分(Combined Positive Score  - CPS)即着色的肿瘤细胞、淋巴细胞及巨噬细胞数之和占全部存活肿瘤细胞的百分比,再乘以100。 


FDA获批CDx产品

PD-L1表达量的检测主要依赖于4种单克隆抗体,其中3种已有FDA批准的相应CDx产品:


Note: Ventana PD-L1 sp-26检测试剂盒获NMPA批准用于尿路上皮癌。

 

3.2

肿瘤突变负荷(TMB

Tumor Mutational Burden


同PD-L1一样,基因组特性(Genomic Signature)也是一类评估受益的伴随诊断试验,其中包括TMB, MSI和MMR。TMB用于判断肿瘤细胞能否有效被免疫系统识别

TMB指肿瘤细胞基因组中,所评估基因的编码区发生置换和插入和(或)失性突变(体细胞突变)的总数,通常按每兆碱基(Mb)中的突变数计算。TMB水平高的肿瘤,代表着肿瘤细胞中能被免疫系统识别的肿瘤新抗原(Neoantigen)数量可能越多,从而免疫系统能对肿瘤细胞产生有效杀伤,实现好的治疗效果。

CheckMate026研究首次在前瞻性队列中证实了TMB对免疫治疗具有预测作用,高TMB者应用纳武利尤单抗治疗显著获益,其中PD-L1表达(TPS≥50%)者PFS获益更为明显。KEYNOTE010、KEYNOTE042、POPLAR和OAK研究亦显示,帕博利珠单抗和阿替利珠单抗单药治疗疗效与TMB呈正相关。然而,在系列化疗联合PD-1抑制剂临床研究中,未观察到TMB与化疗联合免疫治疗疗效的相关性。


TMB的检测及CDx产品

ctDNA,全基因组测序、全外显子测序和选择性基因测序。TMB检测成本高、普及率低、有效cut-off值不确定、组织样本和血液样本TMB结果一致性及缺乏前瞻性研究等,在一定程度上均限制了其广泛的临床应用。(尚未有FDA的单独获批产品,仅包含在panel类产品中)

Note: *标记为Panel类产品

其他可配合检测的治疗药物 (尚未纳入指南)

O药 Opdivo (nivolumab); Tecentriq (atezolizumab); Yervoy (ipilimumab)

 

3.3

微卫星不稳定(MSI
基因错配修复功能(MMR

Microsatelite Instability / DNA Mismatch Repair

人类错配修复基因(MMR基因)经转录翻译后可表达相应的错配修复蛋白,如果任一MMR蛋白表达缺失(dMMR),可造成细胞的错配修复功能缺陷,则对DNA复制过程中的碱基错配丧失修复功能,从而造成累积,进一步导致MSI的发生。约15%的结直肠癌是由MSI途径引发的。


MSI分为MSI-H, MSI-L, MS-S;MMR分为dMMR(基因错配修复功能缺陷),pMMR(基因错配修复功能完整)。dMMR等同于MSI-H,pMMR等同于MSI-L或MS-S。

高度微卫星不稳定(MSI-H)的肿瘤多为高TMB,两者存在一定相关性。反之,高TMB的患者不一定是MSI-H。


MSI/MMR的检测及CDx产品

MMRIHC检测:MMR的IHC检测包括对4个错配修复蛋白表达的检测,只要四个蛋白里任何一个蛋白的表达是缺失的(阴性),肿瘤就属于dMMR;如果四个蛋白全部表达阳性,肿瘤是pMMR。(尚未有FDA单独获批的产品)


MSI
PCR/NGS检测:同时需要肿瘤细胞和对应正常细胞,对肿瘤细胞DNA中5个(美国NCI规定的标准位点,也有11个等)微卫星位点的长短进行检测,与对应的正常细胞DNA进行比较。如果其中有两个或两个以上的位点是不稳定的,为MSI-H,一个位点不稳定为MSI-L,5个位点都一样为MSS。检测11个位点时,>=30%位点不稳定为MSI-H,0-30%为MSI-L,全部稳定为MSS。(尚未有FDA单独获批的产品,仅包括在panel类产品中)


Note: *标记为Panel类产品

其他可配合检测的治疗药物 (尚未纳入指南)


K药 Keytruda (pembrolizumab); O药 Opdivo (nivolumab); Yervoy (ipilimumab)



04

其他及总结


此之外,FDA还批准了一种在以上两类之外的标记物: 肝铁浓度(Liver Iron Concentration,LIC),以De Novo分类方式提交。 该CDx产品通过特定MRI影像定量肝铁浓度,是一种无创的LIC检测方法,试剂被美国FDA,澳大利亚TGA及欧盟CE批准用于非输血依赖型地中海贫血患者,帮助选择地拉罗司(Deferasirox)治疗药物的适用患者。

 
最后,可以看出FDA批准的伴随诊断试剂以靶向药物相关的肿瘤单基因检测为主(HER2最多,EGFR和BRAF次之),panel类检测已有FoundationOne Medicine和Life Technologies相关产品获证;免疫类CDx除了TMB和MSI检测包含在了之前提到的panel产品中,仅有Dako和Ventana两家公司的PD-L1免疫组化CDx获批。

完整的FDA批准产品可以在fda.gov进行查询。


 

REFERENCES

“List of Cleared or Approved Companion Diagnostic Devices (In Vitro and Imaging Tools)”, fda.gov
“Understanding Targeted Therapy”, cancer.net
Foundationone CDx Technical Specifications

《中国非小细胞肺癌PD-L1表达检测临床病理专家共识》

“免疫治疗时代,你必须知道的MSI/dMMR” 肿瘤咨询

“List of Cleared or Approved Companion Diagnostic Devices (In Vitro and Imaging Tools)”, fda.gov



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