近期新冠病毒突变体研究进展及80多种抗原汇总

新冠病毒通过Spike蛋白受体结合域RBD识别并结合宿主细胞表面受体ACE2，介导病毒包膜与细胞膜融合过程，使得S蛋白成为中和抗体和疫苗的主要抗原靶点，因此S蛋白（尤其是RBD）的位点突变也是人们关注的重点。

RBD突变可能会增强与受体结合的亲和力、减弱中和抗体效应或者造成病毒免疫逃逸。据《Cell》报道，Q493、Q498和N501位点突变会提高病毒与人体细胞表面ACE2受体的亲和力，增强新冠病毒的传染力。在小鼠模型中，通过实验已经证实N501Y能够增强病毒与人和小鼠ACE的结合亲和力。Furin蛋白酶切割位点对宿主细胞结合能力影响巨大，而P681H突变靠近Furin酶切位点，可能是S蛋白与ACE2亲和力提高千倍的因素。69-70del可能有利于病毒逃逸宿主免疫反应。

研究发现此突变株毒株有23个特殊的突变，包括14个非同义突变（氨基酸改变）、6个同义突变（非氨基酸改变）和3个删除，这是首次发现在一个毒株上出现如此多的变异。这其中有8个突变均发生在Spike蛋白上，以下3个突变位点尤其引起研究者的关注，并且需要加强对其监测。

-- N501Y，可增强新冠病毒与人或者鼠ACE2的结合

-- 69-70del，可引起免疫逃逸

-- P681H，靠近Furin酶切位点

义翘神州已成功开发多种与此突变位点相关的产品，可以用于新冠病毒的中和抗体及疫苗研究：

根据南非相关单位的研究数据，发现突变株主要是Spike蛋白存在8个突变，其中包括RBD的3个重要残基：K471N、E484K和N501Y。其中E484K和N501Y属于受体结合基序，是与人ACE2受体结合的主要位点。

南非突变体位点（图源：medRxiv）

对南非突变体的研究发现了最令人担忧的事情。1月19日美国的研究团队在bioRxiv的预印本文章，发现mRNA新冠疫苗对南非突变株的防护能力可能有所下降，研究人员从接种疫苗的志愿者体内分离出中和抗体，其中有22种抗体对南非突变体中的一种突变位点的中和活性下降超过5倍。这提醒我们需要加强对新冠病毒突变体的持续监测。

义翘神州同样开发出南非突变体相关产品供科学研究使用：

根据Faria等13日在Virological提交的报告，发现存在K417T、E484K、N501Y等多个位点的突变。

巴西突变株系统进化树及突变位点（图源：Virological）

义翘神州根据已发布的序列信息，体外重组表达相关突变位点的蛋白，可以用于新冠病毒相关的研究：

根据SSI的研究报告，丹麦水貂体内分离出5中突变株，其中Y453F具有重要研究意义。Y453F突变体新冠病毒Spike蛋白第453位的氨基酸由酪氨酸（Y）突变为苯丙氨酸（F），可能是为了更适应水貂宿主。除Y453F突变之外，还包括：69-70del、692V、S1147L、M1229I等。

义翘神州目前已开发出两种水貂相关的突变体重组蛋白：

现在，义翘神州已开发80多种重组Spike、N抗原突变体蛋白，涵盖了包括上述提及的突变位点在内的多种突变位点。具体位点如下：

点击“阅读原文”，查看详细新冠突变体相关试剂信息。

【参考文献】

1. https://virological.org/t/preliminary-genomic-characterisation-of-an-emergent-sars-cov-2-lineage-in-the-uk-defined-by-a-novel-set-of-spike-mutations/563.

2. The Impact of Mutations in SARS-CoV-2 Spike on Viral Infectivity and Antigenicity.

3. Tegally, et al. Emergence and rapid spread of a new severe acute respiratory syndrome-related coronavirus 2 (SARS-CoV-2) lineage with multiple spike mutations in South Africa. medRxiv.

4. Faria, et al. Genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in Manaus: preliminary findings. https://virological.org.

5. ARS-CoV-2 spike mutations arising in Danish mink and their spread to humans. Working paper of SSI.

6. Wang, et al. mRNA vaccine-elicited antibodies to SARS-CoV-2 and circulating variants. bioRxiv.

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