EBioMedicine柳叶刀子刊 | 沈柏用/方海/王朝夫/张恒辉团队发表首个中国胰腺癌队列拷贝数变异驱动的分子分型研究成果

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资讯来源：BioArt

发布时间： 2021-12-08

胰腺癌（PAAD）是最致命的癌症之一，仅在中国每年就造成约80000例新死亡。现行的组织学风险分层未能为正确的患者找到正确的治疗方法。基于突变基因的分层也取得了有限的进展。胰腺癌(PAAD)的高死亡率表明患者预后较差且缺乏有效的系统治疗手段，目前尚缺乏指导胰腺癌患者预后和治疗的分子分型研究。因此需要探索PAAD患者的分子分型并构建预后模型以区分复发风险，以期为胰腺癌患者寻找合适的治疗方式和预测预后提供帮助。

2021年11月25日， 上海交通大学医学院附属瑞金医院沈柏用/方海/王朝夫团队联合无锡臻和生物科技有限公司（以下简称“臻和科技”）张恒辉团队 在EBioMedicine 在线发表题为“Identification of copy number variation-driven molecular subtypes informative for prognosis and treatment in pancreatic adenocarcinoma of a Chinese cohort”的研究论文，首次在一个大型的中国队列中揭示了胰腺癌患者的分子分型，强调了常规进行分子分型检测以帮助管理胰腺癌患者的重要性，本研究中构建的分子亚型和预后模型可转化应用于改善胰腺癌患者的诊断、治疗和管理。

本研究试图通过全面描绘中国队列中胰腺癌患者的基因突变谱，确定分子亚型并建立预后模型，以帮助选择最合适的治疗方案。首先，本研究未发现高突变频率基因和同源重组修复(HRR)基因的点突变存在预后价值，有可能与有限数量的突变基因可能无法为胰腺癌这样的复杂癌症提供预后信息有关。其次，本研究采用无监督聚类和CNV评分分层相结合的方法将PAAD患者分为四个分子亚型，包括修复缺陷、增殖活跃、修复完整和修复增强，其中修复缺陷型和增殖活跃型的患者更适合DNA损伤治疗，修复完整型和修复增强型的患者强烈建议进行免疫治疗。此外，利用TCGA-PAAD队列对四种分子亚型进行了验证。最后，我们构建了一个根据复发风险对患者进行分层的预后模型，有助于及早识别复发高风险患者。另外研究结果证实高危或低危预后评分的PAAD患者之间的肿瘤微环境存在差异，在TCGA队列中，低风险患者比高风险患者拥有更多有益的肿瘤微环境。

该研究描述了一个涉及608名PAAD患者的遗传变异的综合资源，这是中国有史以来最大的队列研究，并且全部收集在一个中心。概述的基因改变包括体细胞突变、拷贝数变异（CNV）和许多其他，它们提供的证据表明，不使用体细胞突变，仅使用DNA修复和受体酪氨酸激酶相关基因的CNV信息可以将患者分为预后信息亚型。他们进一步表明，基于这些基因的预后模型可以预测复发风险低或高的患者。这项研究强调了进行分子分型以指导PAAD患者治疗的重要性：修复缺陷型和增殖活跃型患者更适合DNA损伤治疗，而免疫治疗则强烈建议用于修复完整型和修复增强型患者。

上海交通大学医学院附属瑞金医院胰腺外科沈柏用主任医师，国家转化医学中心（上海）方海研究员，病理科王朝夫主任医师以及臻和科技张恒辉研究员为本文的共同通讯作者。上海交通大学医学院附属瑞金医院胰腺外科詹茜副主任医师，温晨磊主治医师以及臻和科技赵义博士为本文的共同第一作者。