清华大学丁强团队揭示SARS-CoV-2感染宿主所需的ACE2基因决定因子

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关键词: 揭示因子基因
资讯来源:医学权威
所属行业:疫苗
发布时间: 2021-03-25

2021年3月25日,清华大学丁强团队在PLoS pathogens上发表了题为“Comparative analysis reveals the species-specific genetic determinants of ACE2  required for SARS-CoV-2 entry”的研究论文,该研究基于考拉、小鼠ACE2序列与人ACE2序列的比较结果,通过遗传和功能分析,发现了决定考拉和小鼠ACE2不能有效结合SARS-CoV-2 S蛋白使其进入宿主细胞的关键位点。



研究者为了确定限制考拉和小鼠ACE2病毒受体活性的遗传决定因素,基于ACE2-S蛋白复合物的结构图,通过分析不同ACE2直系同源物种S蛋白的RBD表面氨基酸残基,发现很多氨基酸残基通过互相形成氢键或π-π键来维持复合物结构,例如ACE2的K31和K353与RBD的Q493和G502的羧基氧形成氢键,从而提供大量的能量来稳定ACE2-S蛋白复合物,但是考拉(T31 和F83)及小鼠(F83和 H353)相应的关键氨基酸残基与其他物种存在差异,可能导致病毒无法进入其体内。


▲ ACE2中的潜在残基限制了SARS-CoV-2的进入


为了直接揭示考拉和小鼠ACE2中这些不同的残基对病毒进入的影响,研究者观察了带有人源化氨基酸残基的突变小鼠和考拉结合S蛋白及介导病毒的能力:将Fc和SARS-CoV-2的S1融合蛋白与过表达带有绿色荧光报告基因的不同物种ACE2的A549细胞共孵育,通过流式细胞术检测绿色荧光中S1蛋白阳性的百分比,来评估结合能力。


结果显示,S1-Fc与表达小鼠或考拉ACE2的A549细胞的结合非常低,与空载体转导的细胞中观察到的水平相当,而S1-Fc蛋白与表达人ACE2的A549细胞有效。结合人与小鼠hACE2 Y83F / K353H双突变体显著降低了结合率(49.9%vs 98.1%), 人与考拉的单个hACE2 K31T突变体具有显著受损的结合(52.8%vs 98.1%),随着残基353突变(K31T / K353H;28.6%vs 98.1%)而进一步降低,表明K31对ACE2与S蛋白相互作用至关重要;而双重人源化小鼠(mACE2 F83Y / H353)和考拉(kACE2 T31K / F83Y)突变体表现出更高的结合效率(83.9%和92.1%),尽管F83Y突变本身对小鼠或考拉ACE2与SARS-CoV-2 S蛋白的结合影响极小,但分别将此突变与H353K或T31K结合具有协同作用,以上结果表明小鼠ACE2中的残基353和考拉ACE2中的残基31是这两个直系同源物结合S蛋白的物种特异性限制的遗传基础。


为了确定这些研究结果是否仅适用于SARS-CoV-2 S蛋白,研究者还评估了这些突变体结合SARS-CoV S蛋白的能力。与SARS-CoV-2 S蛋白相反,小鼠ACE2可以结合SARS-CoV S蛋白(40.4%vs 0.8%)。小鼠ACE2中的单突变或双突变(F83Y,H353K或F83Y / H353K)进一步提高了结合效率(分别为63.7%,83.1%或81.8%),有时甚至超过了人类ACE2的结合效率(64.0%)。有趣的是,与SARS-CoV-2 S蛋白不同,野生型或人源化考拉ACE2与SARS-CoV S蛋白的结合能力都非常弱。这些表明,尽管SARS-CoV和SARS-CoV-2都以人ACE2作为进入细胞的受体,但是受体相互作用和识别在功能上存在重要的差异,这可能会导致这两个病毒之间的宿主范围,组织嗜性和致病性存在差异。


▲ SARS-CoV-2进入所需的ACE2基因决定因子



▲ ACE2突变体结合病毒刺突蛋白


接下来,为了进一步明确ACE2变体的异位表达具有功能性,且可以促进表达S蛋白的MLV逆转录病毒颗粒(以Fluc为报告基因)进入A549细胞,研究者通过用不同的假病毒颗粒接种表达ACE2变体的A549细胞并进行孵育后,裂解细胞并测定萤光素酶活性以确定假病毒颗粒是否成功进入。结果表明,与野生型同源基因相比,小鼠和考拉F83Y ACE2变体均未显着增加病毒进入。相反,mACE2 H353K和kACE2 T31K各自显著增强了病毒的进入现象,并且在双重人源化突变体中有明显的协同作用,通过改变一个或两个氨基酸使小鼠或考拉ACE2人源化导致介导SARS-CoV-2进入的能力。


与此同时,研究者还发现小鼠ACE2可以与SARS-CoV和SARS-CoV-2的S蛋白结合,并分别介导假颗粒的进入,但不与考拉结合。相比之下,人源化的考拉ACE2只能结合SARs-CoV-2的S蛋白,并仅介导表达该蛋白的假病毒颗粒的进入。这些观察结果突显了SARS-CoV和SARS-CoV-2通过ACE2进入所使用的不同机制。


▲ ACE2同源基因及其人源突变体介导SARS-CoV-2和SARS-CoV假病毒颗粒进入的能力


另外,研究人员为了直接测试ACE2直系同源基因介导病毒感染过程中SARS-CoV-2进入的能力,在缺乏内源性ACE2表达且不易感染SARS-CoV-2的A549细胞中进行了基因互补实验。通过细胞内病毒核衣壳蛋白的免疫荧光染色,发现表达小鼠或考拉ACE2的A549细胞不易感染SARS-CoV-2,而表达人ACE2的细胞则易受感染,进一步确证了考拉(T31K)或小鼠(H353K)ACE2中的F83Y突变进一步可提高感染效率。同时,研究者利用腺病毒在小鼠体内表达人源化的小鼠(H353K)ACE2,该小鼠可以支持SARS-CoV-2的感染。
▲ ACE2突变体在体外促进病毒进入的能力


综上所述,该研究为SARS-CoV-2与细胞受体ACE2之间相互作用的物种特异性提供了更多信息,确定了SARS-CoV-2宿主范围的遗传基础,为SARS-CoV-2研究开发新的动物模型奠定基础。


   原文链接: 

   https://doi.org/10.1371/journal.ppat.1009392

   编辑:Naomi



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