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冷冻电镜,诺奖技术
冷冻电子显微镜 (cryoEM) 是一项快速发展的技术,它有助于确定生物大分子的高分辨率结构,并阐明它们在细胞内的分子学功能。在过去的几十年中,冷冻电镜已经从确定看起来像单纯斑点的低分辨率结构发展到原子分辨率的常规结构确定。近些年,被解析的蛋白质或蛋白质复合结构的数量迅速增加,这主要是得益于低温电镜领域的技术发展。
2017 年,Richard Henderson、Jacques Dubochet 和 Joachim Frank 获得了诺贝尔化学奖,他们为冷冻电镜从“blobology”(模糊不清一坨)过渡到高分辨率结构测定奠定了基础。
作为结构生物学重磅武器,冷冻电镜技术有力促进了新靶点发现,并加速了创新药的研发进程。
近些年,影响全球的新冠疫情爆发,冷冻电镜对新冠病毒SARS-CoV-2相关蛋白的结构表征再次展示了其强大能力和发展速度。在病毒爆发后的几个月内,科学家通过冷冻电镜获得了单独的病毒刺突蛋白几种构象,以及其与人血管紧张素转换酶或大量中和人源抗体片段的复合物结构。
最近获得FDA突破性批准用于治疗新冠的再利用药物瑞德西韦,其与 SARS-CoV-2 RNA 聚合酶结合结构也已通过冷冻电镜确定。鉴于X射线晶体学一直是病毒RNA聚合酶结构测定的传统方法,这一应用,令人侧目,它强化了冷冻电镜在快速响应研究中的实用性。
除了新冠药物以外,冷冻电镜在新冠疫苗领域也有着广泛应用。
2022年2月份,辉瑞发布2021财报,其中辉瑞和BioNTech公司联合研发的mRNA新冠疫苗Comirnaty营收达到了创纪录的367.81亿美元,问鼎新“药王”。在过去很多年,老药王“Humira修美乐”,曾8年蝉联全球销售额冠军。另外一家企业Moderna公司mRNA新冠疫苗2021年总销售额达到177亿美元。2款百亿美元重磅mRNA疫苗产品,也吸引了更多的企业和投资人参与到mRNA疫苗研发竞赛,mRNA疫苗不仅仅局限在新冠预防领域,还有更广阔的癌症疫苗等等待探索。
递送环节是mRNA疫苗最大挑战之一,作为大分子长链的mRNA,本身带有负电荷,直接跨膜递送存在挑战;另外,mRNA分子本身稳定性相对较差,易被各种酶降解。脂质纳米颗粒LNPs递送技术的突破,解决了mRNA递送和稳定性2大难题,大大促进了mRNA疫苗的发展。
脂质纳米颗粒LNPs的包封率、载药量与稳定性直接对mRNA疫苗的安全性、有效性、稳定性等产生影响。通过对LNPs进行透射电镜成像,研究人员可以对来直接观测LNPs的囊泡结构、粒径等形态信息,进而对处方和工艺进行优化。大大促进了研发效率,并提高成功率。
冷冻电镜在新兴的AAV载体技术领域同样备受关注
AAV载体技术,目前在基因疗法以及疫苗递送领域也有广泛研究和应用。腺相关病毒 (AAV) 具有单链 DNA 基因组,包裹在具有 60 个亚基的小二十面体对称蛋白壳中。
除了被用于结构鉴定外,冷冻电镜现在也被用作AAV 载体产品的工艺开发和生产质量控制的分析工具。
冷冻电镜可用于检测过程相关杂质,例如残留的核酸、宿主细胞蛋白或碎片,或辅助病毒的残留。AAV样本中病毒粒子的相对分布是一个关键的质量属性,其治疗效果与完整颗粒的数量直接相关,冷冻电镜可以对样品中空的、满的及介于中间的包封的病毒粒子进行量化。
在检测包封率方面,超速离心沉降法(SV-AUC)是当前量化相对包封率的“金标准”,电荷检测质谱 (CDMS) 是另一种选择。冷冻电镜的优势是可直接可视化观察到样品,而且比电荷检测质谱更容易获得、比超速离心沉降法需要更少的材料。
随着越来越多的大分子药物以及复杂递送技术的问世,冷冻电镜技术愈发显示出强大的威力和广阔的应用场景。
在此背景下,药融圈联合赛默飞共同组织这场技术交流会,围绕3个主题进行分享:《冷冻电镜助力核酸药物递送系统研发与质检》,《新冠疫苗研发回顾及展望》,以及《LNP、AAV、外泌体等纳米颗粒药物递送载体的透射电镜检测方法》,共同推动行业进步!


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参考文献:
--上市公司财报
--Michael J. R. et al. Drug discovery in the era of cryo-electron microscopy. Trends in Biochemical Sciences 2022 Feb;47(2):124-135
--Scott M. S. et al. Cryo-electron Microscopy of Adeno-associated Virus. Chemical Reviews. Chem Rev. 2022.
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--Chi, X. et al. A neutralizing human antibody binds to the N-terminal domain of the Spike protein of SARS-CoV-2. Science 369, 650–655
--Liu, L. et al. Potent neutralizing antibodies against multiple epitopes on SARS-CoV-2 spike. Nature 584, 450–456
--Walls, A.C. et al. Structure, function, and antigenicity of the SARS-CoV-2 spike glycoprotein. Cell 181, 281–292
--Yan, R. et al. Structural basis for the recognition of SARSCoV-2 by full-length human ACE2. Science 367, 1444–1448
--Kokic, G. et al. Mechanism of SARS-CoV-2 polymerase stalling by remdesivir. Nat. Commun. 12, 279