腾迈医药发布基于浏览器的图形界面平台TandemViz™ 1.0——实现计算分析结果和实验室数据的无缝集成 | 会员动态
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关键词：
发布药医药
资讯来源：同写意 + 订阅账号
发布时间：
2023-03-29
3月28日，腾迈医药重磅发布TandemViz™ 1.0版本，TandemViz™可以为腾迈不断增长的新药研发客户群体提供用户友好的图形界面和高效的团队协作工具。客户可通过浏览器直接访问工具平台，无需安装任何软件，即可调用腾迈的计算工具套件，并实现实验数据和计算分析结果的可视化无缝集成。
图1：Login:基于浏览器的交互界面，2-step验证确保数据安全
“TandemViz™是我们
整合先进的计算技术与湿实验数据的核心平台
，”腾迈医药的首席技术官Albert Pan博士表示，“用户可以通过该平台直接访问
腾迈自主开发的自由能微扰(FEP)工作流及配套算力
，旨在通过
卓越的算法和计算性能，显著加速药物发现进程
，包括苗头化合物发现、先导化合物优化等。同时，对于希望将FEP等计算工具的优势最大化并同步推动多个药物发现项目进程的负责人而言，TandemViz™界面是一种
改变游戏规则的工具
- 项目团队可以
充分挖掘计算结果和实验数据的洞见，包括原子级模拟数据，
来理解分子结构优化的方向，设计更好的分子。”
图2：TandemPose模块呈现蛋白-配体对接后的结构形态
腾迈医药的工作流程包括蛋白质-小分子对接模块、从量子力学精确导出小分子力场参数的力场模块以及使用FEP计算小分子效能的模块。TandemViz™还提供了一个强大的数据分析界面，可以轻松地将化合物的活性分析与特定残基-分子片段间相互作用相结合，将计算结果和智能化实验数据集成为项目数据集。腾迈自主开发的FEP工作流程已经通过了多个benchmark数据集和客户项目反复、充分的验证，平均准确度达到<1 kcal /mol。未来推出的版本还将提供更全面的计算功能，包括化合物分子生成设计工具、十亿级高通量虚拟筛选工具等。
图3：TandemNetmap中的原子映射编辑器，方便客制化定义计算过程中的common core vs soft core
“Viz的交互界面将力场参数化和再参数化及细节丰富的可视化模拟功能模块相互集成，对于深度挖掘小分子与靶点结合的计算洞见至关重要，”
QuantX Biosciences的联合创始人兼首席技术官Yax Sun博士是TandemViz™以及腾迈集成计算和湿实验解决方案的早期用户之一
，他表示
“这些洞见能帮助我更好地聚焦药物化学设计本身。”
Yax在加入QuantX之前曾在安进公司工作超过20年，并担任计算化学主管。
图4. TandemAnalytics:头对头展示计算和湿实验结果，汇总建模结果并量化配体-残基的相互作用
图5. TandemAnalytics:3D动画还原模拟全过程，可视化检视关键相互作用
腾迈医药成立于2021年底，
目前在全球范围内为50多个客户提供药物发现服务；
腾迈药物发现服务平台整合了物理建模、人工智能与生物物理学、药物化学和生物学等跨学科交叉应用，实现“干湿实验室”的深度结合。公司在中国上海和苏州设有湿实验室，并承载150多名科学家。腾迈医药于近期完成了3500万美元的A轮融资，将进一步扩大其平台建设和业务范围。
腾迈医药是一家致力于用先进计算技术重塑药物分子发现流程的平台型科技公司, 公司将专有的基于量子力学及人工智能驱动的高性能计算平台与规模化高效湿实验室相结合, 以提供一站式解决方案。腾迈医药在苏州，上海，纽约和波士顿开展业务，云端部署的高性能计算平台和算力, 大大提高了客户和合作伙伴药物分子发现的速度, 降低了新药分子发现成本。
同写意论坛是中国新药研发行业权威的多元化交流平台，十九年来共举办会议论坛百余期。“同写意新药英才俱乐部”基于同写意论坛而成立，早已成为众多新药英才的精神家园和中国新药思想的重要发源地之一。同写意在北京、苏州、深圳、成都设立多个管理中心负责同写意活动的运营。
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