Nat Commun | 熊炜/曾朝阳团队揭示EB病毒编码miRNAs增强PD-L1表达促进免疫逃逸的机制

EB病毒（EBV）是首个被发现的致瘤病毒，与鼻咽癌、胃癌及多种淋巴瘤的发生、发展密切相关；同时EBV也是第一个被发现可以编码miRNA的病毒，它能编码44个成熟miRNAs，这些miRNAs参与了细胞增殖、凋亡和恶性转化等过程。免疫逃逸是肿瘤发生、发展的关键环节之一，而免疫检查点分子PD-1及其配体PD-L1对肿瘤免疫逃逸和免疫治疗至关重要【1】。然而EBV编码的miRNAs在肿瘤免疫逃逸中的作用和机制尚未阐明。

2022年2月14日，中南大学肿瘤研究所熊炜、曾朝阳团队在Nature Communications发表了题目为EBV miRNAs BART11 and BART17-3p promote immune escape through the enhancer-mediated transcription of PD-L1的最新研究成果。该研究发现EBV编码的miRNAs BART11和BART17-3p分别靶向抑制FOXP1和PBRM1这两个转录调控蛋白，而FOXP1和PBRM1能共同结合于PD-L1的增强子区并抑制PD-L1表达，因此BART11和BART17-3p通过解除FOXP1和PBRM1对PD-L1的转录抑制，上调PD-L1表达，从而促进EBV相关肿瘤发生免疫逃逸。

该研究首先在两种EBV相关实体肿瘤，鼻咽癌和胃癌，的临床样本中分析发现PD-L1在肿瘤组织中显著高表达，且与EBV感染呈显著正相关。体外细胞实验中发现BART17-3p、BART11-3p和BART11-5p促进PD-L1表达的效果最明显。进一步通过生物信息学分析和实验验证了BART17-3p的靶分子为PBRM1，而BART11（包括BART11-3p和BART11-5p）的下游靶分子为FOXP1。

FOXP1是叉头盒 (forkhead box) 转录因子家族中的一员。该分子在多种实体瘤中常作为一个转录抑制因子发挥抑癌作用。PBRM1是SWI/SNF染色质重塑复合物的一个亚基，能影响组蛋白修饰，抑制靶基因的转录。该研究通过免疫共沉淀、染色质构象捕获（3C）等实验发现FOXP1能与PBRM1结合，促进SWI/SNF染色质重塑复合物PBAF亚型的组装，PBAF结合于PD-L1增强子，影响其H3K27ac和H3K4me1修饰从而抑制PD-L1的表达。BART11和BART17-3p则分别靶向抑制FOXP1和PBRM1这两个PD-L1上游转录抑制蛋白表达，从而增强PD-L1的表达。

该研究进一步通过肿瘤细胞与T细胞共培养实验，以及构建裸鼠皮下种植瘤模型进行过继T细胞治疗，结合注射PD-L1抑制剂（Atezolizumab）验证了BART11和BART17-3p通过上调肿瘤细胞表面PD-L1表达，促进T细胞凋亡，抑制T细胞杀伤功能，进而促进肿瘤细胞发生免疫逃逸。该研究拓展了人们对EBV相关肿瘤免疫逃逸分子机制的理解，并为EBV相关肿瘤的免疫治疗提供了潜在的靶点。

这是该课题组继发现EBV编码的环状RNA circBART2.2通过RIG-I通路诱导PD-L1表达的机制之后的又一新发现【2】。

中南大学肿瘤研究所博士生汪婕为该论文第一作者，曾朝阳研究员、熊炜研究员为共同通讯作者。中南大学肿瘤研究所博士生葛军尚、王忆安等参与了该研究。

原文链接：

https://www.nature.com/articles/s41467-022-28479-2

1. Jiang, X., et al. Role of the tumor microenvironment in PD-L1/PD-1-mediated tumor immune escape. Mol Cancer 18, 10 (2019).

2. Ge, J.S., et al. Epstein-Barr virus-encoded circular RNA circBART2.2 promotes immune escape of nasopharyngeal carcinoma by regulating PD-L1. Cancer Research 81, 5074-5088 (2021).